专访LAKEbio铼科生物胡云龙博士
液体活检(Liquid biopsy)作为一种非侵入式的检测方式,在精准医疗领域备受关注。目前,液体活检技术主要通过血液、尿液等样本检测、监测肿瘤或转移病灶释放的循环肿瘤细胞(CTCs)、循环肿瘤DNA(ctDNA)、外泌体(Exosome)及循环RNA(Circulating RNA)等生物标志物。而样本作为液体活检所有检测流程的基础,在检测结果可靠性方面有着决定性的作用。因此,血液、尿液等样本的保存及运输是液体活检中的关键环节之一。
测序中国:胡博士,血液作为目前液体活检研究的热门样本,其保存的难点有哪些?铼科生物是如何解决这些问题的?
胡云龙博士:液体活检由于具有一些组织活检不可替代的应用优势,可对肿瘤、遗传病等疾病进行无创检测、诊断、治疗指导和监测,在科研和临床领域已经有了突破性的进展。目前,液体活检的主要检测样本类型是血液,此外还包括尿液、脑脊液等。事实上,血液样本通常进行离心后,使用干冰进行冷链运输送到有资质的第三方检测机构进行分析。之所以选择冷链运输,是因为血液中的有核细胞会裂解释放出基因组DNA,污染血液中的游离核酸(cfDNA),影响检测结果。此外,细胞裂解所释放的核酸酶也会降解cfDNA,破坏检测的灵敏度,导致达不到第三方机构的检测要求,这是当前血液样本保存的主要难点。
测序中国:为解决上述游离核酸保存面临的难点,铼科生物进行了哪些技术创新?
胡云龙博士:LAKEbio目前拥有多项核心技术,并且所有的化学配方全部为自主研发,包括保护剂配方。公司针对临床NIPT应用场景推出了一款无甲醛的cfDNA专用采血管,可以避免孕妇血液中细胞来源基因组DNA对cfDNA的污染,同时还能防止样本中cfDNA的降解,以及防止cfDNA和其他生物大分子(如蛋白质)发生交联。该cfDNA采血管适用于遗传性疾病检测,与行业内的对标产品(Streck)相比,可同样实现常温保存样本14天,并保持细胞形态的完整性和稳定性。此外,利用Lakebio和Streck采血管分别收集孕妇外周血,常温运输4天后进行血浆分离,检测到的胎儿cfDNA百分比接近,且数据精确度基本一致。表明Lakebio采血管在长时间保持血液中胎儿cfDNA稳定性方面达到了国际水平,并且其保存样本可以用于下游的高通量测序和诊断报告的输出。值得一提的是,Lakebio游离DNA常温保存管在NIPT领域已经有数百万级别的使用量,可以有效支撑第三方检测体系的规范化及大批量运行。
测序中国:谈及产品申报注册,您认为游离核酸保存管产品开发和注册需要注意哪些问题?
胡云龙博士:医疗器械开发和注册的两个核心问题就是安全和有效。开发方面,该类产品必须保障cfDNA的高质量,以匹配下游的测序工作。液体活检需要大数据做支撑,因此必须有夯实的理论基础,需要通过大规模的实验验证,并进行一系列的优化,以保证产品的有效性。注册方面,产品必须严格按照国家的医疗器械法规执行注册流程,保障产品在临床应用上的有效性和安全性。然后才可以放心对接临床患者或对健康检测有意愿的人群。
测序中国:液体活检除了血液,还有其他样本来源,包括尿液、唾液等。对于不同的检测样本和靶标,铼科生物目前的产品应用情况如何?
胡云龙博士:目前,液体活检中针对血液样本的研究相对较多,同时脑脊液、尿液、唾液等体液也可以作为液体活检的样本来源,其中所包含的部分潜在生物标志物可以反映个体的健康状态。为满足不同类型样本的保存运输需求,Lakebio推出了一系列生物样本保存产品,包括游离DNA/RNA常温保存管、唾液DNA采集管、口腔拭子DNA保存管、尿液游离DNA保存管、脑脊液和肺泡灌洗液游离DNA保存管等。经过不断地试剂配方优化以及大规模市场验证,使用公司已有产品保存的样本可适用于下游的高通量测序等基因检测场景。
测序中国:随着液体活领域的发展,能否分享铼科生物未来在样本保存方面的业务布局?
胡云龙博士:近年来,液体活检伴随着NGS的发展而兴起。与传统的组织活检相比,液体活检作为一种非侵入性检测手段,具有无创性、敏感性、动态性等特征,在临床研究中大放异彩。该领域当前主要针对血液进行研究。基于此,Lakebio产品主要的核心之一也是血浆保存处理,同时,其它样本包括唾液、尿液、汗液等也都需要稳定的保存体系。针对这些不同来源的样本,Lakebio研发了一系列具有良好保存效能的专利性保护产品。此外,FDA已经批准了两个基于NGS的ctDNA液体活检产品,这给了我们一个很大的可切入性。未来,Lakebio将基于已有的专利保护产品和开发经验,继续为匹配不同的样本,不同的应用场景,不同的研发内容进行产品的优化拓展。